A Lista Bioquímica

BIOQUÍMICA – LISTA 3

1. Que critérios relacionados às proteínas poderiam ser relacionados com

os métodos de purificação destas (cromatografias e eletroforeses)?

Solubilidade, tamanho, carga elétrica e afinidade são critérios para purificação de

proteínas. Cromatografia: processo através do qual moléculas presentes em misturas

complexas podem ser separadas com base nas suas solubilidades em diferentes

solventes e em suas mobilidades em diferentes substratos. A Eletroforese em gel é

uma técnica de separação de moléculas que envolve a migração de partículas em um

determinado gel durante a aplicação de uma diferença de potencial. As moléculas são

separadas de acordo com o seu tamanho, pois as de menor massa irão migrar mais

rapidamente que as de maior massa.

2. Explique brevemente o porquê da hemoglobina, proteína com estrutura

quaternária, apresentar propriedade tamponante no sangue e apresentar

variação na afinidade pelo gás oxigênio provocada por variações no pH

sanguíneo (quanto menor for o pH, menor a afinidade da hemoglobina por

oxigênio).

Este fenômeno é explicado pelo efeito Bohr. O aumento da concentração de CO2,

leva a diminuição do pH. Este aumento da acidez, relacionado a baixa pO2 tecidual,

faz com que a hemoglobina libere O2 e capte h+, impedindo que ocorram grandes

variações de pH. Nos pulmões a situação inverte-se. A alta pO2 leva a oxigenação da

hemoglobina e a dissociação de h+. A liberação de prótons pela hemoglobina corrige

o valor de pH que, de outro modo tenderia a aumentar pois, com a baixa do pCO2

alveolar, o CO2 é eliminado no ambiente, consumindo h+ e HCO3-. A AFINIDADE DA

HEMOGLOBINA POR O2 MUDA DE ACORDO COM A FORMA DA MOLECULA. A

ESTRUTURA PODE SOFRER ALTERAÇÕES DEVIDO AS CARGAS ELETRICAS,

INTERAÇÕES DAS CADEIAS LATERAIS, BEM COMO VARIAÇÃO DE

TEMPERATURA E PH.

4. Definir

a) cooperatividade e indicar que tipo(s) de proteínas pode(m) exibir essa

propriedade.

A cooperatividade resulta da influência exercida por um sítio sobre outros localizados

em subunidades diferentes de uma mesma molécula, só pode ser representada por

proteínas oligoméricas (mais de uma cadeia polipeptídica), como a hemoglobina e as

enzimas alostéricas.

b) constante de Michaelis-Mentem (KM) e mostrar a relação entre seu valor e a

afinidade da enzima pelo seu substrato.

A KM relaciona concentração de substrato e velocidade de uma reação. Quanto maior

a concentração do KM (para chegar ao Vmax), menor a afinidade da enzima pelo seu

substrato.

c) inibidor competitivo e não-competitivo. Mostrar num gráfico (Vo x [S]) os

resultados de uma inibição competitiva e em outro uma inibição nãocompetitiva, em comparação a uma curva obtida na ausência de inibidores.

A inibição enzimática é a redução da velocidade de uma reação enzimática provocada

por uma molécula. Inibidor competitivo: apresenta estrutura semelhante ao substrato

da enzima que se liga para realizar a catálise. Ela liga-se ao sítio ativo da enzima, que

não pode realizar o processo catalítico, pois seu sítio ativo está ocupado para poder

ligar-se ao substrato correto. Portanto o inibidor compete como substrato pelo sítio de

ação. Inibição não competitiva: Um inibidor não competitivo pode se combinar com a

enzima livre ou com o complexo ES, interferindo na ação de ambos. Esses inibidores

ligam-se a um sítio da enzima diferente do sítio ativo. O inibidor não competitivo não

se assemelha com o substrato, mas apresenta uma grande afinidade com a enzima.

É o mecanismo inverso do inibidor competitivo, porque inibe a ligação do complexo

ES e não da enzima livre.

d) cofator, coenzima, enzima alostérica, sítio alostérico e efetuadores

alostéricos positivo e negativo.

Enzimas alostéricas são enzimas que contêm uma região separada daquela em que

se liga o substrato, na qual pequenas moléculas regulatórias (efetuadores) podem

ligar-se e modificar a atividade catalítica destas enzimas, isto acontece no sítio

alostérico da enzima. Ao ligar-se à enzima, o efetuador alostérico pode aumentar a

atividade catalítica (efetuador positivo) ou diminuir a atividade catalítica (efetuador

negativo), através de modificações no sítio catalítico. Muitas enzimas alostéricas são

oligoméricas (constituídas de múltiplas subunidades), geralmente estão localizadas

em um ponto de ramificação, ou próximo a ele, em uma via metabólica, influenciando

no direcionamento de substratos para uma ou outra via disponível.

Cofatores são substâncias orgânicas ou inorgânicas necessárias ao funcionamento