TCC Desafios Biobancos

Esses SOPs descreveram detalhadamente o ciclo de vida de um espécime à medida que ele se desloca pelo laboratório e quais etapas exigem documentação específica, como a hora em que as amostras chegaram ao laboratório, o momento em que a amostra foi acessada, qual usuário estava realizando o análise, o método utilizado no pedido de análise (ligado ao seu próprio SOP), e o tempo de conclusão da tarefa, para citar alguns. Desta forma, o LIMS foi capaz de se adaptar a quase todos os processos de documentação manual que ocorrem neste fluxo de trabalho específico

O Zope fornece funcionalidade de segurança integrada que nos permite definir funções com permissões. Uma “permissão” controla se usuários logados ou anônimos com uma função específica podem executar código e acessar o conteúdo. Cada membro da equipe NSB e cliente terá funções específicas atribuídas e um nível de segurança. O LIMS da Baobab também herda o sistema de gerenciamento de documentos controlado por versão do Plone e os fluxos de trabalho do revisor e trilhas de auditoria.

O Plone usa o ZODB para armazenar dados do usuário. O ZODB, comparado com bancos de dados baseados em SQL, não é vulnerável à injeção, pois usa o formato binário que não pode ter dados do usuário inseridos. O Plone autentica usuários em seu próprio banco de dados usando um hash de algoritmo hash seguro (SSHA) salgado de sua senha. Usando seu sistema de autenticação modular, o Plone também pode autenticar usuários contra sistemas de autenticação comuns, como LDAP e SQL, bem como qualquer outro sistema para o qual um plugin esteja disponível (Gmail, OpenID, etc.). Após a autenticação, o Plone cria uma sessão usando um hash SHA-256 de um segredo armazenado no servidor, o ID do usuário e a hora atual. Isso é baseado no formato do cookie Apache auth_tkt, mas com uma função hash mais segura.

Biobanks e pesquisa em biobanking têm um papel cada vez mais importante na pesquisa e no fornecimento de serviços de saúde, à medida que os sistemas de saúde se tornam mais centrados no paciente e a medicina se torna mais personalizada.

Prevê-se que a integração do biobanking em todos os níveis de investigação e cuidados de saúde biomédicos, epidemiológicos e aplicados a doenças específicas, aumentará o progresso na investigação em saúde e diminuirá os custos tanto dos ensaios clínicos como dos cuidados de saúde diários [ 9 ]. Tratar os pacientes e as organizações de pacientes como parceiros integrais nesse processo é fundamental para avançar em direção a um modelo de atenção centrado no paciente, construindo assim a base para os pacientes assumirem a responsabilidade pelo gerenciamento de seus cuidados e saúde geral

Dificuldades

• considerar cuidadosamente a infra-estrutura de TI apropriada que pode atender às demandas de grandes estudos genéticos.
• financiadores para garantir que os grupos autorizados a coletar amostras tenham recursos informáticos suficientes para garantir que as amostras sejam usadas.  Os custos técnicos em um biobanco vão além do apoio a um LIMS e devem incorporar um sistema de gerenciamento de informática biobanco que permita ao biobanco a flexibilidade para atender às crescentes demandas técnicas de disponibilizar dados para uma comunidade científica mais ampla além do manuseio de amostras biológicas em um laboratório. As demandas impostas à equipe de TI exigem que os biobancos tenham pessoal dedicado para essas funções técnicas, aumentando, assim, pelo menos cinco vezes os custos de pessoal. 
• Dado que os dados e as amostras são coletados prospectivamente, não há clareza sobre quais projetos de pesquisa eles apresentarão. Assim, o biobanco não pode ser adequadamente específico quanto ao objetivo do processamento.
• Como o biobanco não pode ser específico em relação à finalidade do processamento, o biobanco não poderá ser adequadamente específico quanto aos potenciais receptores de dados.
• Se o biobanco deseja operar internacionalmente, não pode, com antecedência, listar os países para os quais os dados serão transferidos.
• Os bancos biológicos recolhem amostras humanas - estas contêm os genomas completos dos titulares dos dados. Há uma enorme quantidade de dados contidos no genoma e o desenvolvimento da ciência genética permitirá que volumes cada vez maiores de dados sejam extraídos. Portanto, o biobanco não pode fornecer informações sobre quais dados foram realmente coletados.
• Os fatores que contribuem para a falta de uso podem ser a falta de visibilidade (ou seja, os pesquisadores não sabem o que está disponível) ou que os bancos biológicos não atendem às expectativas do pesquisador (como a qualidade da amostra ou a anotação clínica necessária).
• As lacunas permanecem e surgem, refletindo os requisitos em evolução da comunidade de pesquisa e destacam a importância de qualquer biobanco avaliar continuamente a finalidade e o foco da amostra e da coleta de dados. Esta abordagem focada no cliente foi descrita como Biobanking 3.0, 10 com Biobanking 1.0 descrito como tendo o foco principal no número de amostras sendo coletadas, e Biobanking 2.0 sendo um foco maior na qualidade e dados em torno do espécime (mas não necessariamente dados do paciente). ). A mudança de ênfase está longe do grande acúmulo de amostras para coleções mais focadas, garantindo especificamente que os dados em torno da amostra sejam de alta qualidade. 10 Portanto, há um requisito crescente em biobancos para ter recursos informáticos suficientes para garantir que essas demandas sejam atendidas.
• descobriu que quase 40% de seus entrevistados estavam 'Um pouco ou muito insatisfeitos' com seus atuais sistemas de informação. Além disso, enquanto a Application Programming Interfaces (API) e a integração de sistemas foram classificadas como “Importante ou Muito Importante” para um sistema de banco de dados biobanco, 12a capacidade dos sistemas de banco de dados atuais de atender a esse recurso foi classificada no grupo inferior de satisfação. Esse recurso é importante ao tentar integrar dados de várias origens, incluindo registros clínicos. Para adicionar a esta imagem complexa, 34% dos entrevistados usaram planilhas, 36% usaram registros em papel para alguns de seus gerenciamentos de informações, e houve um grande mix de técnicas de rotulagem, com 24% ainda usando tubos de armazenamento de tecido manuscritos, que de O curso tem impacto sobre como as amostras podem ser rastreadas em sistemas eletrônicos.
• Um problema de executar uma pesquisa em vários bancos de dados é o tempo que as consultas podem levar para serem executadas ou a possibilidade de um dos nós estar indisponível. 
• Essas questões implicam muitas conclusões. Primeiro, os biobanners não têm uma visão clara sobre o que está disponível para seu novo negócio. A segunda conclusão é que eles têm pouco tempo para pesquisar e comparar as soluções existentes. Esta segunda conclusão é apoiada pela resposta recebida quando o software adequado é citado: "Como posso usar isso?" Ou "Você tem uma demonstração em algum lugar?". Abordar a segunda demanda é difícil em comparação com outras disciplinas científicas, já que a comunidade de usuários do biobanco requer assistência especial em conjuntos básicos de habilidades em Tecnologia da Informação. Dos 10 bio-bancos, 8 não declararam recursos para o desenvolvimento de projetos de TI (pesquisa feita na França em 2014). Portanto, vemos uma necessidade substancial de conectar Biobanks com especialistas externos baseados em informática.
• Cada um desses grupos tinha necessidades suficientemente semelhantes que uma plataforma central poderia suportar todos eles. Muitos desses bio-bancos tinham orçamentos de suporte de informática modestos e não podiam arcar com soluções de software caras. Todos compartilhavam as necessidades de gerenciamento robusto de estoques, controle de qualidade de QC / QA (controle de qualidade), rastreamento de solicitações e distribuições de amostras, suporte a comitês de alocação de recursos (RACs), etc. Além disso, muitos desses biobanks manejaram amostras coletadas como parte de protocolos de ensaios clínicos, de modo que qualquer sistema de informática precisaria ser capaz de interoperar com um sistema de gerenciamento de ensaios clínicos. Depois de analisar cuidadosamente as opções comerciais disponíveis no mercado e de código aberto disponíveis em 2011, determinamos que, naquela época, nenhuma atendia plenamente aos requisitos desses biobanks.

Introducao

Apresentar referencias,

De acordo com xxxx biobanco é.....

Tirar pq e metodologia

Com base nesta proposta, foi realizada uma revisão sistemática em bases de conhecimento relevantes para a área de saúde, como Google Acadêmico , PubMed, BVS e NCBI.

Falar mais sobre o meu problema

Benefícios do biobanco

.  A informatização dos biobancos possui muitos benefícios (quais)?, porém por outro lado existem muitos desafios para sua implantação. Desta forma, a meta deste trabalho é identificar quais são os principais desafios enfrentados na implantação

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