Bioquimica

Literatura recomendada: Stryer, Bioquímica. Principais capítulos:

Ligações Químicas em Bioquímica.

Estrutura e Função das Proteínas.

Explorando as Proteínas.

DNA, RNA e o Fluxo da Informação Genética.

Enzimas: Conceitos Básicos de Cinética.

A Hemoglobina Transporta Oxigênio Eficientemente por Ligá-lo de Modo Cooperativo.

Glícideos.

Lipídeos e Membranas Celulares.

Metabolismo: Esboço e Conceitos Básicos.

Glicólise e Gliconeogênese.

O Ciclo do Ácido Cítirico.

Fosforilação Oxidativa.

Questões (exemplos meramente ilustrativos; em hipótese alguma esta lista deve ser considerada como contendo todas as perguntas da primeira prova de Biologia I).

Aula 1/2: Bases Epistemológicas e Definições de Vida.

Defina o conceito de “Ciências Naturais”.

Descreva 4 características fundamentais de um ser vivo.

Defina o conceito de “autopoiesis”.

Um vírus pode ser considerado um ser vivo?

Descreva 5 características determinantes da teoria de evolução de Darwin.

Aula 3/4: Fundamentos químicos da vida.

Quais os 5 elementos mais comuns encontrados em seres vivos? Quais são os seus respectivos números atômicos?

Defina o conceito de Isótopo.

Defina “quantidade de matéria n”

Qual seria peso de 1 mol de carbono?

O que é a massa molecular.

O que é molaridade.

Dada a estrutura ou o peso molecular de uma molécula, calcule a massa para obter uma solução de determinada molaridade

Conhecendo o peso molecular de uma substância, saber converter entre concentrações em peso a concentrações molares.

Explique o que se entende por “Energia de dissociação de uma ligação covalente”

Utilizando tabela de energia de dissociação calcular energia de uma molécula.

O que é uma ligação sigma e uma ligação pi. Exemplos.

Características e exemplos moléculas formadas por carbono hibridizado sp3, sp2 e sp.

Exemplos de orbitais deslocalizados

O que é eletronegatividade e para que ela pode ser utilizada.

Calcule o numero de oxidação de moléculas simples.

Defina “química orgânica”

Defina “isômeros”.

O que é conformação?

O que é configuração?

O que é quiralidade?

Identifique a configuração absoluta de algumas moléculas simples (R/S e L/D).

Saiba reconhecer alguns grupos químicos importantes em moléculas biológicas.

Exemplos de forcas não-covalentes intermoleculares.

O que é uma ligação de hidrogênio. Dê exemplos.

O que são as forças de Van der Waals.

O que são ligações iônicas.

Porque a água é polar? Que implicações para as suas características tem este fato?

Explique o efeito hidrofóbico.

O que se entende por anomalia da densidade da água?

Defina pH. Quando é básico/ácido/neutro?

Defina tampão. Porque são importantes na bioquímica?

Calcule o pH de uma determinada solução de um ácido/base forte.

O que é um ácido/ uma base forte?

Aula 5/6: Proteínas

Escreva a estrutura básica de um alfa-aminoácido.

Reconheça os grupos funcionais de um aminoácido.

Reconheça a configuração absoluta de um aminoácido.

Quantos aminoácidos são codificados diretamente pelos genes nas proteínas? Qual a configuração destes?

Qual é a formula estrutural de um aminoácido simples como alanina?

A glicina é quiral?

Desenhe com fórmulas estruturais a reação entre duas alaninas.

Enumere 4 funções de proteínas.

Descreva a ligação peptídica.

O que é “N-terminal” e “C-terminal”.

Uma seqüência peptídica é a mesma quando escrita de forma inversa?

Defina a estrutura primaria, secundária e terciária de proteínas.

De exemplos de estrutura secundária.

Identifique diversos tipos de estrutura secundária numa proteína.

Saiba identificar as duas principais regiões do diagrama de Ramachandran.

O que é “inibição estérica”?

Descreva em breves palavras uma alfa-helix

Descreva em breves palavras uma folha-beta.

O que é uma ponte dissulfeto? Em que proteínas elas são geralmente encontradas?

Onde se encontram as principais ligações de hidrogênio numa alfa-helix? Onde numa folha beta. E a cadeia lateral?

Descreva o experimento de Anfinsen. Qual a importância de este experimento?