Estrtura do gene ATRX

---

Resumo

O gene ATRX pertence à família SI / SNF e está localizado no braço longo do cromossomo X. Possui 281.391 bases e está dividido em 35 regiões de éxons e 34 sequências intrônicas que podem gerar 24 transcritos. Ele é responsável por fornecer instruções para produção de uma proteína que desempenha uma função fundamental no desenvolvimento celular. Embora não se conheça a função específica dessa proteína produzida por ele, estudos sugerem que ela atua na regulação da atividade de outros genes por meio de um processo conhecido como remodelação da cromatina. As mutações neste gene estão associadas com uma síndrome de retardo mental ligada ao X (XLMR) mais frequentemente acompanhada pela síndrome de alfa-talassemia (ATRX). Essas mutações têm mostrado causar diversas mudanças no padrão de metilação do DNA, que pode fornecer uma ligação entre a remodelação da cromatina, a metilação do DNA e a expressão gênica em processos de desenvolvimento.

Palavras-Chave: ATRX, polimorfismos, mutação, síndrome de alfa-talassemia, síndrome de retardo mental ligada ao X, remodelação da cromatina.

---

 

SUMÁRIO

RESUMO --------------------------------------------------------------------------------------------

INTRODUÇÃO -------------------------------------------------------------------------------------

1. ESTRUTURA DO GENE

1.1 Nome Oficial ---------------------------------------------------------------------------------

1.2 Localização cromossômica --------------------------------------------------------------

1.3 Estrutura --------------------------------------------------------------------------------------

1.4 Homologia ------------------------------------------------------------------------------------

CONCLUSÃO -------------------------------------------------------------------------------------

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS --------------------------------------------------------  

---

---

Introdução

O gene ATRX está localizado no braço longo do cromossomo X do genoma humano e possui 281.391 bases. Está dividido em 35 regiões de éxons e 34 sequências intrônicas, que serão melhor aordados em “Estrutura do gene”. Quanto ao grau de conservação evolutivo, o gene possui 70 homólogos, sendo 65 homólogos ortólogos e 3 homólogos parálogos.

O gene possui 24 transcritos, dos quais 14 são codificadores de proteínas.

---

1. ESTRUTURA DO GENE 

1.1 NOME OFICIAL

O gene ATRX  (símbolo oficial do gene) e nome oficial completo segundo a HGNC (Hugo Gene Nomenclature Committee) pertence à família SWI/SWF de proteínas de remodelação da cromatina. Pode ser encontrado também como:  ATRX, Chromatin Remodeler; Mental Retardation, X-Linked 52; ATP-Dependent Helicase ATRX; X-Linked Nuclear Protein; X-Linked Helicase II; ZNF-HX; RAD54L; XH2 XNP; Alpha Thalassemia/Mental Retardation Syndrome X; Linked (RAD54 (S. Cerevisiae) Homolog); Alpha Thalassemia/Mental Retardation Syndrome X; Linked (RAD54 Homolog, S. Cerevisiae); Alpha Thalassemia/Mental Retardation Syndrome X; Linked DNA Dependent ATPase And Helicase Transcriptional Regulator ATRX; RAD54 Homolog (S. Cerevisiae); Juberg-Marsidi Syndrome; Zinc Finger Helicase; Helicase 2, X-Linked; EC 3.6.4.12; EC 3.6.1; MRXHF1; MRX52; RAD54; ATR2; SFM1; SHS; JMS.

Também conforme a HGNC, o ATRX é registrado pelo Gene ID: 886. No Ensembl (Ensembl genome database Project) este gene é registrado por: ENSG00000085224, bem como no OMIN (Online Mendelian Inheritance in Man) pelo ID: 300032.

De acordo com a Genetics Home Reference, o ATRX está na localização citogenética: Xq21.1, que é o braço longo (q) do cromossomo X na posição 21.1 e também possui a Localização Molecular: pares de bases 77.504.878 a 77.786.269 no cromossoma X.

[pic 1]

Imagem 1.1: Regiões intrônicas e exônicas do gene ATRX. Disponível em:

Fonte: https://ghr.nlm.nih.gov/gene/ATRX#location

1. ESTRUTURA DO GENE

O gene ATRX possui 281.391 bases de comprimento, está dividido em 35 regiões de éxons, sendo os 35 codificantes. Os éxons são intercalados por 34 sequências intrônicas e podem gerar 24 transcritos por splicing alternativo, de acordo com o Ensembl.
A imagem 1.2 demonstra a estrutura do gene de acordo com o catálogo do Ensembl: As regiões quadradas representam as regiões UTR do gene, enquanto as linhas diagonais representam os íntrons e as linhas verticais, os éxons.  

[pic 2]
Imagem 1.2: Regiões intrônicas e exônicas do gene ATRX. Fonte: Ensembl. Disponível em: http://www.ensembl.org/Homo_sapiens/Transcript/Summary?db=core;g=ENSG00000085224;r=X:77504878-77786269;t=ENST00000373344

Os 24 transcritos do gene ATRX possuem um número variado de éxons, por exemplo: (transcrito ATRX-001) possui 35 éxons, (transcrito ATX-002) apresenta 34 éxons, (transcrito ATRX-0010) possui 14 éxons, (transcritos ATRX-007/ATRX-0012) possuem 5 éxons. Sendo os 14 primeiros transcritos codificadores de proteínas. O primeiro éxon do gene ATRX está entre as bases 77.786.269 e 77.785.982, e o segundo éxon, entre as bases   77.717.243  e  77.717.131.   Apresenta a região UTR 5’ (Untranslated Region 5’), indicada na Imagem 1.3 pelos retângulos em vermelho. A região UTR 3’, indicada na Imagem 1.4, é consideravelmente mais extensa do que a região UTR 5’ (final do éxon 35). Essas regiões são transcritas em RNAm.

[pic 3]

Legenda paras as figuras de bases[16].

[pic 4]
Imagem 1.3: Região UTR 5’ do gene ATRX, indicada em vermelho. O conjunto de todas as bases da imagem forma o éxon 1 deste gene.[16]

TTNATCAGCTGTGTTCAGNGAATACNTANGAACAGAAGGCTNCAGCAGCAGTANANTCAG

CAGCAACAGCAACAAATGACTTATCAACAAGCAACACTGGGTCACNTCATGATGCNAAAN

CCCCCNNATTTGNTNATGAATCCTTCTANCTACCAGCAGATTGATNNGAGAGGAATGTNT

CAGCCAGTGGCTNNNNGNNNNNAGCNACCACCATTACAGCNTGCACCACCCNCANTGANA

AGCAAAAATCCAGNACCTTCCCAAGNGAAATCANTGTGATTTNNCACTAAANGCTTAATG

GATTNTTNAAATCANAGAAAGATCTTTTNTNTNTTTAGGAATCAATGACTTAACAGAACT