Bioquímica/Biofísica – Ramatis

Bioquímica/Biofísica – Ramatis

22/02/16

Biomolécula - molécula que existe dentro de um organismo vivo Ex. aminoácido, glicose, sacarose. Basicamente formadas por oxigênio, carbono, hidrogênio e nitrogênio.

Carbono selecionado para formar biomoléculas por fazer 4 ligações estáveis, sendo um átomo pequeno, podendo se combinar com facilidade a outros elementos formando diversas funções químicas

Toda interação dentro da célula respeita a orientação espacial, toda vez que o carbono faz uma ligação simples existe uma livre rotação entre as moléculas

Toda vez que ocorre uma dupla, os ligantes estão em um mesmo plano geométrico, não rotando. O que vale para a dupla vale para a ressonância da dupla.

Configuração – como a molécula se estabelece

Conformação - mudanças após a molécula se estabelecer (ligantes alinhados ou não(escalonada), alinhados possui uma energia maior e menor estabilidade (eclipsada)).

Acoplamento energético

Algumas reações que precisam de energia utilizam a de outras, que liberam. ATP ADP

29/02/16

Água se liga através de

Pontes de hidrogênio – 90% eletrostática, 10% covalente

Água foi selecionada assim como o carbono, por haver propriedades especificas, uma delas a formação de pontes de hidrogênio, inclusive com ela mesma

Como a água se organiza em rede, uma interação em um lado de uma célula afete quase instantaneamente toda ela (assim como os elétrons na corrente).

O oxigênio por ser eletronegativo atrai os elétrons dos hidrogênios (na água), ficando com carga negativa e deixando os hidrogênios com carga positiva, gerando as cargas necessária para ter uma interação eletrostática.

Se se liga/dissolve com a água, faz ponte de hidrogênio

Compostos apolares na agua fazem interações hidrofóbicas, apolares acabam comprimidos em meio aos polares.

Todas as interações entre enzima-substrato são fracas, normalmente pontes de hidrogênio

Açucares/glicoproteína são altamente polares.

Raft – bloco/ilha que permite a proteínas ficarem perto uma da outra para interagirem (cada uma das proteínas está imóvel, mas como um conjunto são moveis.

Curral – outra delimitação de espaço que permite interações diminuindo o espaço disponível para uma proteína da membrana, mas continua móvel dentro do espaço delimitado.

 07/03/16

Co-transporte – transporte de um soluto é dependente do transporte de um segundo

Simporte – quando o co-transporte transporta um soluto na mesma direção do que fornece energia

Antiporte - quando o co-transporte transporta um soluto na direção oposta do que fornece energia

Na maioria das vezes quando o co-transporte utiliza sódio ele pode ser considerado ativo

Canal iônico realiza apenas transporte passivo, se não há diferença de concentração o canal não funciona.

Transportadores podem realizar tanto transporte passivo quanto ativo

14/03/16

Se duas placas paralelas estão separando dois meios podem apresentar capacidades físicas, principalmente a capacitância

Canal de vazamento de potássio – permanentemente aberto, deixa vazar potássio do meio interno levando uma carga positiva, deixando uma carga negativa, as concentrando dentro da célula. Diferença de cargas entre o lado externo e o lado interno da célula é o potencial de membrana

À medida que o potássio vai saindo da célula, sua saída vai sendo dificultada, devido ao gradiente eletroquímico, o meio interno tem carga negativa e atrai o potássio.